Naisten Suomen Cupissa turnausmuotoisilta kierroksilta jatkoon on seuloutunut yhteensä yhdeksän joukkuetta. Näiden seuraksi kolmannelle kierrokselle liittyvät naisten seitsemän liigajoukkuetta.

Kolmannen kierroksen kahdeksan otteluparia on arvottu. Seitsemästä mukana olevasta liigajoukkueesta muodostui kaksi liigajoukkueparia, SB-Pro kohtaa PSS:n ja TPS emännöi Classicia. Molemmat kolmannelle kierrokselle selvinneet juniorijoukkueet kohtaavat toisensa SB-Pron tyttöjen SM-joukkueen matkatessa Kooveen junioreiden vieraaksi.

Kolmannen kierroksen (neljännesvälierät) otteluparit:
Tiikerit (liiga) – KaPa-65 (2.div)
SB-Pro (liiga) – PSS (liiga)
Koovee B (TSM) – SB-Pro B (TSM)
NST (liiga) – SB Vantaa (1.div)
Steelers (1.div) – ÅIF (1.div)
Papas (1.div) – JoKa (2.div)
M-Team (liiga) – HaHy (2.div)
TPS (liiga) – Classic (liiga)

Kolmannen kierroksen runkopäivä on 14.10.2012.